V rastlinjaku je rastno okolje rastline umetno usmerjeno in nadzorovano. Dejavniki, kot so temperatura, vlažnost, svetloba in ogljikov dioksid, sestavljajo tako-imenovano »mikroklimo«, ki jo s strukturo, opremo in metodami upravljanja stabiliziramo znotraj območja, ki je najbolj ugodno za rast pridelkov. Razumevanje načel in obvladovanje praks sta ključna za učinkovito in trajnostno delovanje rastlinjakov.
Nadzor toplote in temperature. Rast rastlin je izjemno občutljiva na temperaturo; dnevne temperaturne razlike in sezonska nihanja neposredno vplivajo na hitrost rasti, obdobje cvetenja in pridelek. V stopnjah rasti večine zelenjadnic se dnevne temperature vzdržujejo med približno 22 stopinj in 28 stopinj, medtem ko se nočne temperature znižajo na 16 do 20 stopinj, da se prepreči pregrevanje ali motena diferenciacija cvetnih popkov. Rastlinjaki uravnavajo temperaturo s pasivnimi in aktivnimi metodami: na eni strani z uporabo izolacijskih lastnosti filmov, stekla ali plošč za zmanjšanje toplotnih izgub; po drugi strani pa uravnavanje toplote s prezračevanjem, senčenjem in sevanjem tal.
Ko je sončna svetloba intenzivna, lahko senčne mreže zmanjšajo škodljive učinke prekomerne izpostavljenosti svetlobi; ko so temperature visoke, strešna okna, stranske zavese in naravno prezračevanje pomagajo pri odvajanju toplote; v hladnih sezonah ogrevalni sistemi vzdržujejo najnižjo nočno temperaturo, da preprečijo mirovanje korenin ali poškodbe pridelka zaradi zmrzali.
Vlažnost in upravljanje vode. Pri enaki temperaturi lahko prekomerna vlaga hitro povzroči bolezni, medtem ko nezadostna vlaga ovira transpiracijo in povzroči sušenje listov. Relativno vlažnost v rastlinjakih se zaradi stabilnosti običajno vzdržuje med 60 % in 75 %, vendar imajo različni pridelki nekoliko drugačne nastavitve in zahtevajo fino-uravnavanje glede na stopnjo rasti. Razmerje med namakanjem in transpiracijo je ključnega pomena; kapljično namakanje in mikro-razpršilni sistemi se običajno uporabljajo za odmerjeno oskrbo z vodo, ki istočasno dovajajo hranila in vodo v območje korenin, kar zmanjšuje izhlapevanje vode in širjenje površinskih patogenov. Ločevanje deževnice in odpadne vode, odvodnjavanje in ponovna uporaba so prav tako običajne prakse v sodobnih rastlinjakih, da bi se izognili odpadni vodi in kopičenju soli.
Učinkovitost svetlobe in fotosinteze. Svetloba je vir energije za rastline; premalo sončne svetlobe ali neustrezna fotoobdobja bodo upočasnila rast in vplivala na učinkovitost fotosinteze. Rastlinjaki zagotavljajo, da pridelki prejmejo zadostno in enakomerno razporejeno svetlobo s pravilno postavitvijo, senčenjem in dodatno umetno svetlobo, kadar je to potrebno.
